Luke Skywalker et Leia Organa durent les affronter peu après la Bataille de Yavin, lors d'une mission sur Vorzyd V. Puis, comme la Main de l'Empereur qu'ils servaient disparut en pleine Guerre Civile Galactique, on les vit rejoindre plusieurs autres factions Impériales. Ainsi, alors qu'il gagnait en influence après la Bataille d'Endor et surtout la dernière Mort de l'Empereur, le Seigneur Noir des Sith Carnor Jax s'entoura d'une garnison de Stormtroopers de l'Ombre qu'il intégra à son armée privée ; précisons que lui-même avait été l'un d'entre eux avant de rejoindre la Garde Royale Impériale. Lord Shadowspawn avait lui aussi fait appel au service de ces sombres troupes quelques années plus tôt.
La couleur inhabituelle des tenues portées par les Stormtroopers de Blackhole était en fait due au résistant polymère avec lequel elles avaient été fabriquées. Ce ne fut néanmoins pas suffisant pour venir à bout de Kir Kanos, celui-ci ayant tué les derniers membres connus de ce groupe avant de prendre part à son Dernier Combat dans La Tornade.