Lorsque les Guerres Mandaloriennes éclatèrent, la République Galactique se trouva en grand manque de vaisseaux pour assurer sa défense sur la très large ligne de front. C'est pourquoi elle réassigna tous les vaisseaux de classe Foray pour servir d'arrière-garde à la Marine Républicaine. Les Blockade Runners furent alors envoyés en mission sur les mondes tombés aux mains des mandaloriens pour porter secours aux populations et leur fournir des vivres malgré l'occupation. Grâce à leur robustesse, ils pouvaient en effet franchir sans dommage les blocus imposés par les mandaloriens.
Quelques années plus tard, les Blockade Runners continuèrent à forcer les blocus au cours de la Guerre Civile des Jedi. Mais cette fois, c'étaient les blocus républicains qui étaient traversés par les vaisseaux désormais à la solde de l'Empire Sith de Revan.
